「ウォッチャーズになってくれないか？」――メカクシ団からの呼びかけにこたえ、消失した少女を探すために集まったウォッチャーズたちは、次々と発見された謎を考察してゆく。それらをもとにてがかりを求めてメカクシ団は九州や関西に出動、ついに敵の研究所へたどり着く。はたして屈強な男たちの妨害をかいくぐり、無事に少女を取り戻せるのか。少女サーシャと若き研究者M.MBの出会いと過去とは。なぜ少女は消失してしまったのか──。2014年夏に実施された代替現実ゲーム『メカクシ団：ウォッチャーズ ～消失少女捜索大作戦～』で明かされなかった真実やエピソードが明らかに！
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