大学生の仙道海斗は、リアル感覚でバトルを体感できるＶＲ・ＲＰＧゲーム『ネオ・ジェネシス』のトッププレイヤーの一人。アミューズメントパークの中に設置されたブースに入っては、その抜群の身体能力で次々と獰猛なモンスターを倒しゲームクリアを目指している。ある日、海斗はゲーム内で危機一髪のところを一人の青年に救われる。黒い戦闘服に包まれた細い肢体、グレーがかった美しい瞳。儚い美貌とは裏腹な冷淡な口調――伝説のナンバーワン・プレイヤー、シャドウだった。感情を押し殺したような彼の冷ややかな瞳はゲームを楽しんでいるように見えない。なのになぜ彼は毎日、ネオ・ジェネシスにやってくるのか。興味を惹かれた海斗はなんとか現実世界でもシャドウに近づこうと躍起になるのだが、一向に出会うことができず…。そんな時、偶然にも海斗はシャドウの意外な正体、そして過去を知ることになる。
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