よきかな、よきかな──女子高生・琴子が転生したのは、神獣（鹿）のミコ!? 今日も仲間たちとナラの人々の願いを叶えていく。
トラックに轢かれた琴子。気がつくと、公園のような場所で鹿に囲まれていた。違和感を抱えたまま水たまりに映った自分の姿を覗いてみると……私、鹿になってるーーーーー！！！！ 琴子は鹿に転生していたのだった。どうしよう!? え、私、今からどう生きればいいの!? パニックを起こす琴子の前に現れたのは、2頭の若い鹿。彼らに森の中の寂れた神社に案内されて、ここがあなたのお住まいだの、当代のミコ様だの言われたところで、琴子の理解はまるで追いつかない。どうやらミコというのは、この町「ナラ」の神獣である鹿の最高位らしい。そしてその使命は「自然」と対話できる能力を使って、人々を助けること。そこに迷子の捜索願いが舞い込む。琴子たちは鹿たちの協力を仰ぎながら男の子を見つけるべく奔走する。果たして日没前に解決できるのか？ ずぼらな琴子がお世話役の日和と葵、守護者の刻夜（ときや）とともに力を合わせて人々の願いを叶えていく──
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